La alineación de secuencias múltiples bloqueadas se refiere a la construcción de la alineación múltiple al alinear primero las regiones conservadas en lo que llamamos "bloques" y luego alinear las regiones entre bloques sucesivos para formar una alineación final.
- ¿Qué significa el bloque alineado??
- ¿Cuáles son los 3 métodos computacionales básicos para la alineación de secuencias??
- ¿Cómo se hace una alineación de secuencias múltiples??
¿Qué significa el bloque alineado??
El método de alineación de bloques compara genomas en ausencia de la disposición base en las secuencias. En este método, cada genoma se divide en bloques y la comparación de bloques se realiza en función de su contenido (recuentos de nucleótidos), I.mi., el número de A, C, G y T en cada bloque, independientemente del orden.
¿Cuáles son los 3 métodos computacionales básicos para la alineación de secuencias??
Los tres métodos principales para producir alineaciones por pares son métodos de matriz de puntos, programación dinámica y métodos de palabras; Sin embargo, las técnicas de alineación de secuencias múltiples también pueden alinear pares de secuencias.
¿Cómo se hace una alineación de secuencias múltiples??
Comience con la secuencia más similar. Alinee la nueva secuencia con cada una de las secuencias anteriores. Crear una matriz/función de distancia para cada par de secuencias. Cree un "árbol guía" filogenético a partir de las matrices, colocando las secuencias en los nodos terminales.